Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP1O00294 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP1O00294 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP1O00294 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP1O00294 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP1O00294 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP1O00294 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP1O00294 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP1O00294 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP1O00294 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP1O00294 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP1O00294 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP1O00294 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP1O00294 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP1O00294 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TULP1O00294 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TULP1O00294 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TULP1O00294 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TULP1O00294 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TULP1O00294 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TULP1O00294 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TULP1O00294 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TULP1O00294 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TULP1O00294 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TULP1O00294 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP1O00294 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP1O00294 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP1O00294 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP1O00294 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP1O00294 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP1O00294 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP1O00294 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP1O00294 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP1O00294 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP1O00294 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP1O00294 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP1O00294 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP1O00294 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP1O00294 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP1O00294 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP1O00294 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP1O00294 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP1O00294 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP1O00294 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP1O00294 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP1O00294 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP1O00294 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP1O00294 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP1O00294 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP1O00294 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP1O00294 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP1O00294 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP1O00294 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP1O00294 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP1O00294 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP1O00294 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP1O00294 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP1O00294 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP1O00294 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP1O00294 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP1O00294 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP1O00294 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TULP1O00294 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP1O00294 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP1O00294 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP1O00294 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP1O00294 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP1O00294 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP1O00294 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TULP1O00294 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP1O00294 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP1O00294 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP1O00294 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP1O00294 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP1O00294 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP1O00294 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP1O00294 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP1O00294 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TULP1O00294 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP1O00294 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP1O00294 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP1O00294 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP1O00294 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TULP1O00294 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP1O00294 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP1O00294 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP1O00294 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP1O00294 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP1O00294 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP1O00294 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP1O00294 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP1O00294 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP1O00294 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP1O00294 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP1O00294 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP1O00294 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP1O00294 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP1O00294 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP1O00294 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TULP1O00294 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms