Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms