Protein–RNA interactions for Protein: A6NMK8

FAM196B, Protein FAM196B, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM196BA6NMK8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM196BA6NMK8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM196BA6NMK8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM196BA6NMK8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM196BA6NMK8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM196BA6NMK8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM196BA6NMK8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM196BA6NMK8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM196BA6NMK8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM196BA6NMK8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM196BA6NMK8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FAM196BA6NMK8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM196BA6NMK8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM196BA6NMK8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM196BA6NMK8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.7 ms