Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM2BA6NLU5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSTM2BA6NLU5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM2BA6NLU5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM2BA6NLU5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms