Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA6L4A6NEF3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLGA6L4A6NEF3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms