Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR47

SPTY2D1-AS1, SPTY2D1 antisense RNA 1, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms