Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEC24CP53992 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms