RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529482.5

TSSC2-204, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 2 pseudogene, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSSC2, Length 2,337 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC2-204ENST00000529482 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.29■■■□□ 2.6
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TSSC2-204ENST00000529482 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.86■■□□□ 1.89
TSSC2-204ENST00000529482 HRCP23327 699 aa26.69■■□□□ 1.86
TSSC2-204ENST00000529482 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
TSSC2-204ENST00000529482 ABCC9O60706 1549 aa26.48■■□□□ 1.83
TSSC2-204ENST00000529482 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.36■■□□□ 1.81
TSSC2-204ENST00000529482 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
TSSC2-204ENST00000529482 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.28■■□□□ 1.8
TSSC2-204ENST00000529482 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.17■■□□□ 1.78
TSSC2-204ENST00000529482 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.1■■□□□ 1.77
TSSC2-204ENST00000529482 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TSSC2-204ENST00000529482 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.93■■□□□ 1.74
TSSC2-204ENST00000529482 NACADO15069 1562 aa25.7■■□□□ 1.71
TSSC2-204ENST00000529482 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.6■■□□□ 1.69
TSSC2-204ENST00000529482 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
TSSC2-204ENST00000529482 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.52■■□□□ 1.68
TSSC2-204ENST00000529482 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TSSC2-204ENST00000529482 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TSSC2-204ENST00000529482 SCRIBQ14160 1630 aa25.24■■□□□ 1.63
TSSC2-204ENST00000529482 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.07■■□□□ 1.6
TSSC2-204ENST00000529482 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TSSC2-204ENST00000529482 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
TSSC2-204ENST00000529482 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.86■■□□□ 1.57
TSSC2-204ENST00000529482 TRIM41Q8WV44 630 aa24.81■■□□□ 1.56
TSSC2-204ENST00000529482 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TSSC2-204ENST00000529482 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TSSC2-204ENST00000529482 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TSSC2-204ENST00000529482 MYT1Q01538 1121 aa24.44■■□□□ 1.5
TSSC2-204ENST00000529482 NEUROD1Q13562 356 aa24.43■■□□□ 1.5
TSSC2-204ENST00000529482 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.39■■□□□ 1.5
TSSC2-204ENST00000529482 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.36■■□□□ 1.49
TSSC2-204ENST00000529482 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TSSC2-204ENST00000529482 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TSSC2-204ENST00000529482 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TSSC2-204ENST00000529482 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TSSC2-204ENST00000529482 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.28■■□□□ 1.48
TSSC2-204ENST00000529482 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TSSC2-204ENST00000529482 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.18■■□□□ 1.46
TSSC2-204ENST00000529482 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TSSC2-204ENST00000529482 SMARCA4P51532 1647 aa24.14■■□□□ 1.45
TSSC2-204ENST00000529482 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
TSSC2-204ENST00000529482 WIZO95785 1651 aa24.02■■□□□ 1.44
TSSC2-204ENST00000529482 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
TSSC2-204ENST00000529482 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.91■■□□□ 1.42
TSSC2-204ENST00000529482 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.89■■□□□ 1.41
TSSC2-204ENST00000529482 CEP162Q5TB80 1403 aa23.87■■□□□ 1.41
TSSC2-204ENST00000529482 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.84■■□□□ 1.41
TSSC2-204ENST00000529482 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.84■■□□□ 1.41
TSSC2-204ENST00000529482 SMARCA2P51531 1590 aa23.83■■□□□ 1.41
TSSC2-204ENST00000529482 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.79■■□□□ 1.4
TSSC2-204ENST00000529482 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
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TSSC2-204ENST00000529482 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.74■■□□□ 1.39
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TSSC2-204ENST00000529482 SOGA1O94964 1423 aa23.62■■□□□ 1.37
TSSC2-204ENST00000529482 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.57■■□□□ 1.36
TSSC2-204ENST00000529482 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
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TSSC2-204ENST00000529482 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TSSC2-204ENST00000529482 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.32■■□□□ 1.32
TSSC2-204ENST00000529482 KIF21BO75037 1637 aa23.32■■□□□ 1.32
TSSC2-204ENST00000529482 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.28■■□□□ 1.32
TSSC2-204ENST00000529482 CLIP1P30622 1438 aa23.27■■□□□ 1.32
TSSC2-204ENST00000529482 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TSSC2-204ENST00000529482 APLP2Q06481 763 aa23.2■■□□□ 1.3
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TSSC2-204ENST00000529482 SYNJ1O43426 1573 aa23.11■■□□□ 1.29
TSSC2-204ENST00000529482 NESP48681 1621 aa23.1■■□□□ 1.29
TSSC2-204ENST00000529482 CFTRP13569 1480 aa23.1■■□□□ 1.29
TSSC2-204ENST00000529482 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
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TSSC2-204ENST00000529482 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.02■■□□□ 1.28
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TSSC2-204ENST00000529482 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.99■■□□□ 1.27
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TSSC2-204ENST00000529482 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.87■■□□□ 1.25
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TSSC2-204ENST00000529482 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TSSC2-204ENST00000529482 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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TSSC2-204ENST00000529482 ARAP1Q96P48 1450 aa22.82■■□□□ 1.24
TSSC2-204ENST00000529482 TOP2BQ02880 1626 aa22.78■■□□□ 1.24
TSSC2-204ENST00000529482 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.77■■□□□ 1.24
TSSC2-204ENST00000529482 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TSSC2-204ENST00000529482 ERCC6Q03468 1493 aa22.73■■□□□ 1.23
TSSC2-204ENST00000529482 PRXQ9BXM0 1461 aa22.73■■□□□ 1.23
TSSC2-204ENST00000529482 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.69■■□□□ 1.22
TSSC2-204ENST00000529482 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.69■■□□□ 1.22
TSSC2-204ENST00000529482 KCNH8Q96L42 1107 aa22.69■■□□□ 1.22
TSSC2-204ENST00000529482 BCL11AQ9H165 835 aa22.68■■□□□ 1.22
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