Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIAS3Q9Y6X2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIAS3Q9Y6X2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIAS3Q9Y6X2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIAS3Q9Y6X2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms