Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC42Q9Y546 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC42Q9Y546 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC42Q9Y546 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms