Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
WASHC2CQ9Y4E1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
WASHC2CQ9Y4E1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
WASHC2CQ9Y4E1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms