Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPH3AQ9Y2J0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPH3AQ9Y2J0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPH3AQ9Y2J0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms