Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2C9

TLR6, Toll-like receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR6Q9Y2C9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TLR6Q9Y2C9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR6Q9Y2C9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLR6Q9Y2C9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms