Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW3

ABT1, Activator of basal transcription 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABT1Q9ULW3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABT1Q9ULW3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABT1Q9ULW3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ABT1Q9ULW3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABT1Q9ULW3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABT1Q9ULW3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms