Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK5

VANGL2, Vang-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL2Q9ULK5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VANGL2Q9ULK5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VANGL2Q9ULK5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VANGL2Q9ULK5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VANGL2Q9ULK5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms