Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD2Q9UKL4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD2Q9UKL4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 880.5 ms