Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MSRAQ9UJ68 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSRAQ9UJ68 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MSRAQ9UJ68 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSRAQ9UJ68 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1524.2 ms