Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS29Q9UBQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS29Q9UBQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS29Q9UBQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS29Q9UBQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS29Q9UBQ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS29Q9UBQ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS29Q9UBQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS29Q9UBQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS29Q9UBQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS29Q9UBQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS29Q9UBQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS29Q9UBQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms