Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCHIP1Q9P0W5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCHIP1Q9P0W5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCHIP1Q9P0W5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms