Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED11Q9P086 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MED11Q9P086 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED11Q9P086 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED11Q9P086 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms