Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRP1BQ9NZR2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRP1BQ9NZR2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRP1BQ9NZR2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms