Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GDAP2Q9NXN4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDAP2Q9NXN4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDAP2Q9NXN4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms