Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ARHGAP35Q9NRY4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ARHGAP35Q9NRY4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
ARHGAP35Q9NRY4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ARHGAP35Q9NRY4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ARHGAP35Q9NRY4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ARHGAP35Q9NRY4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ARHGAP35Q9NRY4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms