Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00597Q9H2U6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC00597Q9H2U6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00597Q9H2U6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00597Q9H2U6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms