Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHE41Q9C0J9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BHLHE41Q9C0J9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHE41Q9C0J9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHE41Q9C0J9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms