Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
THSD7BQ9C0I4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
THSD7BQ9C0I4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
THSD7BQ9C0I4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
THSD7BQ9C0I4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
THSD7BQ9C0I4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms