Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPL4Q9BYD3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPL4Q9BYD3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MRPL4Q9BYD3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms