Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL25A1Q9BXS0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL25A1Q9BXS0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL25A1Q9BXS0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL25A1Q9BXS0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL25A1Q9BXS0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms