Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF7Q9BWX1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF7Q9BWX1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF7Q9BWX1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHF7Q9BWX1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF7Q9BWX1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF7Q9BWX1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF7Q9BWX1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms