Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWL3

C1orf43, Uncharacterized protein C1orf43, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43Q9BWL3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf43Q9BWL3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf43Q9BWL3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf43Q9BWL3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms