Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS25Q9BRG1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VPS25Q9BRG1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms