Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AGPAT1Q99943 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AGPAT1Q99943 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGPAT1Q99943 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGPAT1Q99943 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGPAT1Q99943 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGPAT1Q99943 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGPAT1Q99943 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AGPAT1Q99943 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AGPAT1Q99943 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AGPAT1Q99943 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGPAT1Q99943 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGPAT1Q99943 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGPAT1Q99943 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.2 ms