Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPIN2AQ99865 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIN2AQ99865 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPIN2AQ99865 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms