Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPIN2AQ99865 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPIN2AQ99865 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPIN2AQ99865 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPIN2AQ99865 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SPIN2AQ99865 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIN2AQ99865 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPIN2AQ99865 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SPIN2AQ99865 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPIN2AQ99865 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPIN2AQ99865 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPIN2AQ99865 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPIN2AQ99865 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPIN2AQ99865 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPIN2AQ99865 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIN2AQ99865 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIN2AQ99865 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPIN2AQ99865 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIN2AQ99865 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPIN2AQ99865 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIN2AQ99865 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIN2AQ99865 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIN2AQ99865 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPIN2AQ99865 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPIN2AQ99865 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIN2AQ99865 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPIN2AQ99865 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIN2AQ99865 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPIN2AQ99865 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIN2AQ99865 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIN2AQ99865 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIN2AQ99865 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIN2AQ99865 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIN2AQ99865 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIN2AQ99865 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIN2AQ99865 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIN2AQ99865 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIN2AQ99865 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIN2AQ99865 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIN2AQ99865 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIN2AQ99865 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIN2AQ99865 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIN2AQ99865 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIN2AQ99865 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIN2AQ99865 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIN2AQ99865 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIN2AQ99865 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIN2AQ99865 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIN2AQ99865 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIN2AQ99865 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIN2AQ99865 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIN2AQ99865 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIN2AQ99865 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIN2AQ99865 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIN2AQ99865 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIN2AQ99865 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIN2AQ99865 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIN2AQ99865 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIN2AQ99865 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIN2AQ99865 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIN2AQ99865 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIN2AQ99865 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIN2AQ99865 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIN2AQ99865 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIN2AQ99865 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIN2AQ99865 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIN2AQ99865 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIN2AQ99865 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPIN2AQ99865 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIN2AQ99865 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIN2AQ99865 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIN2AQ99865 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIN2AQ99865 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIN2AQ99865 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIN2AQ99865 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIN2AQ99865 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIN2AQ99865 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIN2AQ99865 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIN2AQ99865 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIN2AQ99865 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIN2AQ99865 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIN2AQ99865 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIN2AQ99865 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIN2AQ99865 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIN2AQ99865 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIN2AQ99865 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIN2AQ99865 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIN2AQ99865 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIN2AQ99865 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIN2AQ99865 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIN2AQ99865 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIN2AQ99865 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIN2AQ99865 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIN2AQ99865 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIN2AQ99865 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIN2AQ99865 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIN2AQ99865 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIN2AQ99865 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIN2AQ99865 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIN2AQ99865 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms