Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C12orf66Q96MD2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf66Q96MD2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms