Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABS1Q96KC9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CABS1Q96KC9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CABS1Q96KC9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.7 ms