Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWCEQ96DN2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VWCEQ96DN2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VWCEQ96DN2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VWCEQ96DN2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms