Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
PRG4Q92954 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PRG4Q92954 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PRG4Q92954 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PRG4Q92954 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
PRG4Q92954 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
PRG4Q92954 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PRG4Q92954 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
PRG4Q92954 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PRG4Q92954 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
PRG4Q92954 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PRG4Q92954 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PRG4Q92954 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
PRG4Q92954 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PRG4Q92954 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PRG4Q92954 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PRG4Q92954 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
PRG4Q92954 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
PRG4Q92954 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PRG4Q92954 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
PRG4Q92954 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
PRG4Q92954 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC39.78■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
PRG4Q92954 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms