Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP2Q8WWK9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP2Q8WWK9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKAP2Q8WWK9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms