Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC4Q8WW27 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC4Q8WW27 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC4Q8WW27 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms