Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM58Q8NG06 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM58Q8NG06 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM58Q8NG06 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms