Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ5

GPRC5A, Retinoic acid-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPRC5AQ8NFJ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPRC5AQ8NFJ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GPRC5AQ8NFJ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPRC5AQ8NFJ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPRC5AQ8NFJ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPRC5AQ8NFJ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPRC5AQ8NFJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPRC5AQ8NFJ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPRC5AQ8NFJ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPRC5AQ8NFJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPRC5AQ8NFJ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms