Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC197Q8NCU1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC197Q8NCU1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC197Q8NCU1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC197Q8NCU1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms