Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD42Q8N9B4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD42Q8N9B4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD42Q8N9B4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD42Q8N9B4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD42Q8N9B4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD42Q8N9B4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD42Q8N9B4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ANKRD42Q8N9B4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD42Q8N9B4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms