Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RPUSD2Q8IZ73 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RPUSD2Q8IZ73 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms