Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCXQ7RTU7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCXQ7RTU7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCXQ7RTU7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms