Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM72Q6ZMU5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM72Q6ZMU5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM72Q6ZMU5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms