Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL3Q5VWW1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QL3Q5VWW1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1QL3Q5VWW1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms