Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
EFCAB2Q5VUJ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
EFCAB2Q5VUJ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
EFCAB2Q5VUJ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
EFCAB2Q5VUJ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
EFCAB2Q5VUJ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
EFCAB2Q5VUJ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
EFCAB2Q5VUJ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
EFCAB2Q5VUJ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
EFCAB2Q5VUJ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
EFCAB2Q5VUJ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
EFCAB2Q5VUJ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
EFCAB2Q5VUJ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
EFCAB2Q5VUJ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
EFCAB2Q5VUJ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
EFCAB2Q5VUJ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
EFCAB2Q5VUJ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
EFCAB2Q5VUJ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
EFCAB2Q5VUJ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
EFCAB2Q5VUJ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
EFCAB2Q5VUJ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
EFCAB2Q5VUJ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
EFCAB2Q5VUJ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
EFCAB2Q5VUJ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms