Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE4DIPQ5VU43 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4DIPQ5VU43 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE4DIPQ5VU43 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4DIPQ5VU43 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4DIPQ5VU43 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4DIPQ5VU43 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4DIPQ5VU43 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4DIPQ5VU43 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4DIPQ5VU43 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms